石上神宮は、大和盆地の中央東寄り、龍王山（りゅうおうざん）の西の麓、布留山（ふるやま・標高266メートル）の北西麓の高台に鎮座し、境内はうっそうとした常緑樹に囲まれ、神さびた自然の姿を今に残しています。北方には布留川が流れ、周辺は古墳密集地帯として知られています。

当神宮は、日本最古の神社の一つで、武門の棟梁たる物部氏の総氏神として古代信仰の中でも特に異彩を放ち、健康長寿・病気平癒・除災招福・百事成就の守護神として信仰されてきました。
　
総称して石上大神（いそのかみのおおかみ）と仰がれる御祭神は、第10代崇神天皇７年に現地、石上布留（ふる）の高庭（たかにわ）に祀られました。古典には「石上神宮」「石上振神宮（いそのかみふるじんぐう）」「石上坐布都御魂神社（いそのかみにますふつのみたまじんじゃ）」等と記され、この他「石上社」「布留社」とも呼ばれていました。
　
平安時代後期、白河天皇は当神宮を殊に崇敬され、現在の拝殿（国宝）は天皇が宮中の神嘉殿（しんかでん）を寄進されたものと伝えています。
　
中世に入ると、興福寺の荘園拡大・守護権力の強大化により、布留川を挟み南北二郷からなる布留郷を中心とした氏人は、同寺とたびたび抗争しました。戦国時代に至り、織田尾張勢の乱入により社頭は破却され、壱千石と称した神領も没収され衰微していきました。しかし、氏人たちの力強い信仰に支えられて明治を迎え、神祇の国家管理が行われるに伴い、明治４年官幣大社に列し、同16年には神宮号復称が許されました。
　
当神宮にはかつては本殿がなく、拝殿後方の禁足地（きんそくち）を御本地（ごほんち）と称し、その中央に主祭神が埋斎され、諸神は拝殿に配祀されていました。明治７年菅政友（かんまさとも）大宮司により禁足地が発掘され、御神体の出御を仰ぎ、大正２年御本殿が造営されました。

禁足地は現在も「布留社」と刻まれた剣先状石瑞垣で囲まれ、昔の佇まいを残しています。